Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms