Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNIP1Q15025 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms