Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms