Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCIRG1Q13488 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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