Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHAF1BQ13112 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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