Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRJQ12913 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRJQ12913 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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