Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms