Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD47Q08722 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD47Q08722 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD47Q08722 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD47Q08722 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms