Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUNX1T1Q06455 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms