Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms