Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms