Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKL1Q00532 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms