Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms