Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms