Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRCC3P46736 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms