Protein–RNA interactions for Protein: P28324

ELK4, ETS domain-containing protein Elk-4, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK4P28324 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELK4P28324 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELK4P28324 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELK4P28324 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELK4P28324 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELK4P28324 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELK4P28324 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK4P28324 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK4P28324 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK4P28324 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms