Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD27P26842 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD27P26842 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD27P26842 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD27P26842 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD27P26842 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD27P26842 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD27P26842 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD27P26842 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD27P26842 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD27P26842 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD27P26842 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD27P26842 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD27P26842 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD27P26842 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD27P26842 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD27P26842 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD27P26842 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD27P26842 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD27P26842 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD27P26842 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD27P26842 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD27P26842 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD27P26842 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD27P26842 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD27P26842 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD27P26842 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD27P26842 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD27P26842 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD27P26842 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD27P26842 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD27P26842 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD27P26842 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD27P26842 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD27P26842 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD27P26842 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD27P26842 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD27P26842 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD27P26842 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD27P26842 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms