Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms