Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VTNP04004 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VTNP04004 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VTNP04004 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VTNP04004 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VTNP04004 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VTNP04004 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VTNP04004 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VTNP04004 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VTNP04004 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VTNP04004 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VTNP04004 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VTNP04004 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VTNP04004 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms