Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F6O75461 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F6O75461 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F6O75461 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F6O75461 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F6O75461 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F6O75461 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F6O75461 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F6O75461 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms