Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB3O43889 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB3O43889 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB3O43889 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB3O43889 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB3O43889 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB3O43889 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB3O43889 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB3O43889 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB3O43889 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CREB3O43889 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CREB3O43889 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms