Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF13O43567 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF13O43567 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF13O43567 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF13O43567 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF13O43567 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF13O43567 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF13O43567 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF13O43567 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF13O43567 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF13O43567 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF13O43567 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF13O43567 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF13O43567 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF13O43567 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF13O43567 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF13O43567 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF13O43567 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF13O43567 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF13O43567 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF13O43567 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms