Protein–RNA interactions for Protein: E9PRG8

C11orf98, Uncharacterized protein C11orf98, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf98E9PRG8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C11orf98E9PRG8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms