Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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CLDN25C9JDP6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CLDN25C9JDP6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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