Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.03■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.03■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
A3GALT2U3KPV4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms