Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRG3Q9Y2Y8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRG3Q9Y2Y8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms