Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms