Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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