Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHX9Q9NQ69 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHX9Q9NQ69 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms