Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ELL3Q9HB65 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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