Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms