Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A6Q92581 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A6Q92581 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms