Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms