Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DNAJA4Q8WW22 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAJA4Q8WW22 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAJA4Q8WW22 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAJA4Q8WW22 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAJA4Q8WW22 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DNAJA4Q8WW22 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA4Q8WW22 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA4Q8WW22 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA4Q8WW22 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA4Q8WW22 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA4Q8WW22 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA4Q8WW22 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DNAJA4Q8WW22 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms