Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms