Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUSD1Q6UWL2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms