Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMARCD3Q6STE5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms