Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC23Q53EV4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms