Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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KRTAP21-1Q3LI58 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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KRTAP21-1Q3LI58 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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KRTAP21-1Q3LI58 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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