Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TAF1AQ15573 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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