Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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