Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
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