Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCN1BQ07699 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms