Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms