Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2NP61088 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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UBE2NP61088 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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UBE2NP61088 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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UBE2NP61088 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2NP61088 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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