Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNB3P54284 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms