Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPC3P51654 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
GPC3P51654 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GPC3P51654 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPC3P51654 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC3P51654 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC3P51654 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC3P51654 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC3P51654 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC3P51654 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC3P51654 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC3P51654 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC3P51654 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC3P51654 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPC3P51654 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms