Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPHP49418 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPHP49418 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPHP49418 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPHP49418 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPHP49418 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPHP49418 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPHP49418 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPHP49418 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPHP49418 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AMPHP49418 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMPHP49418 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
AMPHP49418 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AMPHP49418 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMPHP49418 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMPHP49418 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMPHP49418 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMPHP49418 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMPHP49418 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms