Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPD2P43304 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPD2P43304 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPD2P43304 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPD2P43304 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPD2P43304 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPD2P43304 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPD2P43304 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPD2P43304 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPD2P43304 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPD2P43304 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPD2P43304 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPD2P43304 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPD2P43304 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPD2P43304 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPD2P43304 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPD2P43304 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPD2P43304 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPD2P43304 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPD2P43304 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPD2P43304 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPD2P43304 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPD2P43304 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms