Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJC1P36383 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJC1P36383 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJC1P36383 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJC1P36383 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJC1P36383 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJC1P36383 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJC1P36383 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms